1、逆行性细菌感染
逆行细菌感染时泌尿系统感染的主要原因。肛门一带的细菌，很容易经由尿道逆行到膀胱，停留在泌尿道内，造成感染。女性排尿后，擦拭的方向应由阴道口擦至肛门，即由前向后擦拭，当擦拭方向不对时，容易把阴道和肛门间的细菌逆行带进尿道、甚至膀胱里，引起感染。先天性泌尿道构造异常，如输尿管、膀胱逆流也会造成这种情况。
2、性行为传播
女性的尿道口离阴道和肛门较近，因此在进行性生活时容易把阴道和肛门间的细菌带进尿道、甚至膀胱里，造成感染。
3、避孕不当
错误使用子宫避孕套，会压迫到膀胱，增加泌尿道感染的机会。此外，避孕套上的杀精剂，也会使得阴道内的组织变得脆弱，容易受到细菌感染。
4、水分不足
人体喝水过少，导致身体水分不足，会减少排尿的频率，从而增加细菌停留在膀胱或尿道内的时间，细菌会在这些地方开始繁殖，严重的话会形成感染。
5、憋尿、便秘
长时间憋尿容易因尿液在膀胱停留时间较久，而造成感染机率增加。而便秘者粪便存留在肠道的时间长，粪便内的细菌增加，泌尿道感染的机会也相对增加;或粪便直接压迫到膀胱出口，造成排尿不正常，尿液发生潴留，也容易造成感染。
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